中国农业机械化科学研究院集团有限公司组织体系根据2016年12月中国农机院官网显示，中国农业机械化科学研究院下属10个职能部门，有31个附属单位，共有7家全资子公司、12家控股子公司和5家直属单位，形成了12个生产基地和1个农机物流园

 其中装备制造类14个，研究与试验开发类9个，工程与贸易类4个，出版传媒类1个，现代服务业类3个

 此外，中国农业机械化科学研究院还有20个行业机构，其中重点实验室5个，工程技术中心5个，标准检测机构6个，行业组织机构4个

   职能部门职能部门（10个）：综合管理部、科技发展部、人力资源部、企业经营部、资产财务部、党委工作部、新闻与信息部、监察审计部、国际合作部、战略规划部 院属单位装备制造类（14个）：现代农装科技股份有限公司、中机南方机械股份有限公司、中机美诺科技股份有限公司、洛阳中收机械装备有限公司、中机北方机械有限公司、中机华联机电科技（北京）有限公司、中机华丰（北京）科技有限公司、中国包装和食品机械有限公司、中机康元粮油装备（北京）有限公司、中机嘉峰机械工程有限公司、北京金轮坤天特种机械有限公司、北京天顺长城液压科技有限公司、新疆中收农牧机械公司、中机西南能源科技有限公司 研究与试验开发类（9个）：中国农机院呼和浩特分院、内蒙古华德牧草机械有限责任公司、海拉尔试验站、长春机械科学研究院有限公司、工艺材料研究所、机电技术应用研究所、生物质能工程技术研究中心、行业技术服务中心、中国农机院农机试验站 工程与贸易类（4个）：中机十院国际工程有限公司、中机三勘岩土工程有限公司、中机建工有限公司、海外工程事业部 出版传媒类（1个）：北京卓众出版有限公司 现代服务业类（3个）：中机农业发展投资有限公司、中机象屿农业科技发展有限公司、北京世奥物业管理有限公司 行业机构重点实验室（5个）：土壤植物机器系统技术国家重点实验室、农业生产机械装备国家工程实验室、国家地方联合太阳能干燥工程实验室、国家机械结构安全性与可靠性开放实验室、农业部农产品加工装备重点实验室 工程技术中心（5个）：国家农业机械工程技术研究中心、机械工业植保机械工程技术研究中心、国家草原畜牧业装备工程技术研究中心、机械工业生物质能装备工程研究中心、国家农产品加工技术研发中心农产品加工装备分中心 标准检测机构（6个）：国家农机具质量监督检验中心、国家食品机械质量监督检验中心、全国农业机械标准化技术委员会、全国低速汽车标准化技术委员会、全国风力机械标准化技术委员会、机械工业食品机械标准化技术委员会 行业组织机构（4个）：农业装备产业技术创新战略联盟、食品装备产业技术创新战略联盟、中国农业机械学会、中国食品和包装机械工业协会 

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