山西医科大学基础医学院硬件设施学院现下设13个教研室，分别为：数学教研室、化学教研室、物理学教研室、细胞生物学与遗传学教研室、人体解剖学教研室、组织学与胚胎学教研室、生理学教研室、生物化学与分子生物学教研室、病理学教研室、寄生虫学教研室、微生物学与免疫学教研室、病理生理学教研室、药理学教研室
学院现有博士学位授予点1个、一级学科硕士学位授予点2个、二级学科硕士学位授予点12个
其中，生理学科为国家重点学科；生物化学与分子生物学为山西省重点建设学科，药理学为山西省重点扶持学科
组织学与胚胎学、人体寄生虫学、药理学、微生物学与免疫学4学科为学校重点扶持学科
4个研究所，分别为：生理研究所、肝病研究所、医学寄生虫学研究所和基础医学研究所
7个院管教学实验室，分别为：机能学实验室、形态学实验室、化学实验室、物理学实验室、人体解剖学实验室、生物化学与分子生物学实验室、微生物学与免疫学实验室
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