吉林大学动物医学学院历史沿革清光绪三十年（1904年12月1日），清政府在河北保定正式成立马医学堂，它是中国第一所兽医学校，开始招收兽医正科和速成科生各一班

清光绪三十三年（1907年），北洋马医学堂易名为陆军马医学堂

中华民国1年（1912年），陆军马医学堂改名为陆军兽医学校

中华民国8年（1919年），学校迁往北京富仓

中华民国17年（1928年），学校由国民党南京政府军政部接管，继续招收新生，先后迁往南京、湖南、贵州安顺等地

1949年11月18日，安顺解放，时任代校长的贾清汉率全校师生起义，在西南军区党委领导下，该校改组为中国人民解放军西南军区兽医学校

1951年10月25日，改名为中国人民解放军第二兽医学校

1952年1月，迁往长春，与原军委高级兽医学校、解放军第三、四兽医学校合并，组建成中国人民解放军兽医大学，朱德总司令亲笔题写校名

1992年8月26日，学校改建为“中国人民解放军农牧大学”

1999年4月，根据军委命令，学校改称为“中国人民解放军军需大学”

2004年8月，随着军队编制体制调整，学校转隶移交地方，并入吉林大学，改称“吉林大学农学部”，原军事兽医系改建为吉林大学畜牧兽医学院

2012年11月28日，吉林大学畜牧兽医学院更名为吉林大学动物医学学院

2014年，学院开始试办动物医学（卓越农林人才拔尖培养计划）试验班

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