湖南中医药大学第一临床医学院管理体系作为学校最大的二级单位，该院党委行政高度重视教学工作，有2名院级领导分别主管教学科研工作和学生工作
并设有科教科、学生工作办公室、学生党支部、教研室（16个）等机构，实行了校、系、科三级管理，确保了教学工作的顺利进行
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