中国市长协会领导架构市长代表大会是协会最高权力机构，先后于1991年8月、1996年5月、2001年6月、2006年8月和2015年5月召开

理事会是市长代表大会的执行机构

中国市长协会第五届理事会共有理事263位，其中常务理事88位

北京市市长任会长，住房和城乡建设部部长任执行会长，天津、上海和重庆市市长任荣誉会长；副会长共22位，分别是：住房和城乡建设部一位副部级领导、4个直辖市各一位副市长、15个副省级城市市长、乌鲁木齐市市长(少数民族城市代表)和义乌市市长(中小城市代表)

现任领导成员：会长陈吉宁北京市人民政府市长执行会长王蒙徽住房和城乡建设部部长荣誉会长唐良智重庆市人民政府市长副会长黄艳住房和城乡建设部副部长隋振江北京市人民政府副市长陆克华重庆市人民政府副市长姜有为沈阳市人民政府市长孙喆哈尔滨市人民政府市长周先旺武汉市人民政府市长裘东耀宁波市人民政府市长庄稼汉厦门市人民政府市长罗 强成都市人民政府市长王 琳 西安市人民政府常务副市长（注：西安市市长李明远同志已兼任陇海兰新经济促进会理事长）牙生·司地克乌鲁木齐市人民政府市长王 健义乌市人民政府市长顾问陶斯亮中国市长协会原驻会副会长 

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