吉林建筑大学科研机构截至2023年4月，学校有“松辽流域水环境”“寒地建筑综合节能”2个教育部重点实验室
现有“松辽流域水资源与水环境”吉林省高校重大需求协同创新中心、吉林省建筑电气综合节能重点实验室、吉林省建筑一体化集成技术科技协同创新中心、吉林省结构与抗震科技创新中心、吉林省绿色与生态建材跨区域合作科技创新中心、吉林省新能源与环境科技创新中心、吉林省超导传热材料与中低温热能减碳技术跨区域合作科技创新中心、吉林省寒地绿色建筑技术工程研究中心、“新型建材”吉林省首批校企联合技术创新实验室、吉林省建筑业发展研究基地、吉林建筑文化研究基地在内的39个省（部）级以上科研平台
学校拥有智慧供暖与控制系统集成技术创新团队、低碳建筑材料关键技术研发创新团队等8个省级中青年科技创新卓越人才团队
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