济宁医学院附属医院科室设置医院开设重症医学一科、重症医学二科、重症医学三科、呼吸内一科、呼吸内二科、消化内科、心内一科、心内二科、心内三科、心内四科、心内五科、肾内一科、肾内二科、血液科、内分泌一科、内分泌二科、神经内一科、神经内二科、神经内三科、神经内四科、儿科、肿瘤科、介入治疗科、皮肤科、中医科、风湿免疫科、心理科、胃肠外一科、胃肠外二科、乳腺甲状腺外科、肛肠外科、脊柱外科、骨关节科、创伤骨科、手足外科、胸外科、心脏外科、心脏重症医学科、泌尿外科、烧伤整形美容科、神经外一科、神经外二科、小儿外科、妇科、生殖医学科、产科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、疼痛科、麻醉科、体外循环科、肝胆外科、血管外科、神经外科监护室检验科、血液净化科、营养科、放射科、CT室、磁共振室、超声科等临床与医技科室
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