山西中医药大学院系专业截至2022年12月，学校设有15个二级教学机构，拥有4所直属附属医院、11所非直属附属医院、13所教学医院、18个非医学类实践教学基地，开设21个本科专业，学科专业涵盖医、工、管、理等多个学科门类

 教学机构山西中医药大学第一临床学院山西中医药大学第二临床学院山西中医药大学第三临床学院山西中医药大学第四临床学院山西中医药大学傅山学院山西中医药大学基础医学院山西中医药大学中药与食品工程学院山西中医药大学护理学院山西中医药大学马克思主义学院山西中医药大学人文社会科学学院山西中医药大学健康服务与管理学院山西中医药大学国际教育学院山西中医药大学研究生学院山西中医药大学继续教育学院（职业技术学院、药茶学院）山西中医药大学体育教学部- 本科专业学院专业名称山西中医药大学基础医学院生物工程、生物技术、生物信息学山西中医药大学中医临床学院中医学、中医学（医学英语方向）山西中医药大学针灸推拿学院康复治疗学、针灸推拿学、针灸推拿学（英语方向）山西中医药大学中西医结合临床学院中西医临床医学山西中医药大学护理学院护理学、护理学（涉外护理方向）山西中医药大学医药管理学院信息管理与信息系统、市场营销、公共事业管理山西中医药大学人文学院应用心理学山西中医药大学中药与食品工程学院中药学、中药分析方向（2016年停招）、临床中药学方向、药学、药物分析、中药资源与开发、制药工程、生物制药、生物工程（2018年停招）、食品科学与工程、生物制药方向 直属附属医院附属医院（山西中医药大学附属医院）附属针灸推拿医院（山西省针灸医院）附属中西医结合医院（山西省中西医结合医院）附属晋中医院（晋中市中医院） 

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