赣南科学院科研平台截至2018年2月，科学院下辖赣州市农业科学研究所、赣州市林业科学研究所、赣州市畜牧研究所、赣州市柑桔科学研究所、赣州市烟草科学研究所（市旱作物科学研究所）、赣州市科技情报研究所、赣州市水产研究所、赣州市花卉研究所、赣南树木园、赣州市农机化研究所、赣州市稀土研究所和赣州市钨业研究所、科技发展中心、中心实验室等14个直属单位
赣南科学院建有博士后科研工作站、江西省油茶产业综合开发工程研究中心、江西省科学院赣南分院、江西省林业科学院赣州分院、中科院植物联盟（赣南树木园）、“华中农业大学赣南柑橘农科教合作人才培训基地”、水稻、脐橙、花生三个国家现代农业产业技术体系综合试验站、国家油茶科学中心赣南试验站、国家（赣州）油茶良种繁育基地、赣州市林木良种繁育中心，蔬菜、水禽、生猪、水产四个省现代农业产业技术体系综合试验站
2017年8月19日，“中国稀金谷”科技创新平台—“中国（赣州）稀金新材料研究院”挂牌
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