中国科学技术大学科研平台科研机构截至2019年11月，学校建有12个国家级科研机构、4个国家重大科技基础设施和62个院省部级重点科研机构
国家级科研机构类别机构名称批准部门国家实验室国家同步辐射实验室国家计委国家研究中心合肥微尺度物质科学国家研究中心科学技术部国家重大科技基础设施合肥同步辐射光源国家计委稳态强磁场实验装置（联合）国家发改委未来网络试验设施（联合）国家发改委高精度地基授时系统（联合）国家发改委国家重点实验室火灾科学国家重点实验室国家发改委核探测与核电子学国家重点实验室（联合）科学技术部国家工程实验室语音及语言信息处理国家工程实验室（联合）国家发改委类脑智能技术及应用国家工程实验室国家地方联合工程研究中心热安全技术国家地方联合工程研究中心国家发改委国家国际科技合作基地（联合研究中心）大尺度火灾国际联合研究中心科学技术部国家2011协同创新中心量子信息与量子科技前沿协同创新中心教育部省部共建协同创新中心城市公共安全省部共建协同创新中心教育部 其他国家高性能计算中心（合肥）科学技术部 安徽蒙城地球物理国家野外科学观测研究站中科院级科研机构类别名称率先行动机构中国科学院量子信息与量子科技前沿卓越创新中心中国科学院合肥大科学中心中国科学院比较行星学卓越创新中心中科院重点实验室中国科学院材料力学行为和设计重点实验室中国科学院壳幔物质与环境重点实验室中国科学院近地空间环境重点实验室中国科学院能量转换材料重点实验室（联合）中国科学院星系宇宙学重点实验室（联合）中国科学院量子信息重点实验室中国科学院软物质化学重点实验室中国科学院脑功能与脑疾病重点实验室中国科学院吴文俊数学重点实验室中国科学院电磁空间信息重点实验室中国科学院空间信息处理与应用系统技术重点实验室（联合）中国科学院无线光电通信重点实验室中国科学院强耦合量子材料物理重点实验室中国科学院天然免疫与慢性疾病重点实验室中国科学院城市污染物转化重点实验室（联合）中国科学院微观磁共振重点实验室其他中国科学院国家数学与交叉科学中心—合肥分中心中国科学院强磁场科学中心（联合）中国科学院网络传播系统与控制重点实验室（培育建设）中国科学院太阳能光热综合利用研究示范中心中国科学院量子技术与应用研究中心中国科学院热安全工程技术研究中心 省部级科研机构名称批准单位多媒体计算与通信教育部—微软重点实验室教育部量子信息科学安徽省实验室 安徽省委、省政府先进光子科学技术安徽省实验室 微尺度物质科学安徽省实验室 人工智能安徽省技术创新中心（联合）高性能计算安徽省重点实验室安徽省科技厅分子医学安徽省重点实验室光电子科学与技术安徽省重点实验室计算与通讯软件安徽省重点实验室生物质洁净能源安徽省重点实验室安徽细胞动力学与化学生物学省级实验室金融信息研究安徽省重点实验室安徽省生物质能源工程技术研究中心安徽省污水处理工程技术研究中心安徽省量子信息工程技术研究中心先进功能材料安徽省重点实验室安徽省教育厅物理电子学安徽省重点实验室网络传播系统与控制安徽省重点实验室无线网络通信安徽省重点实验室生物技术药物安徽省工程技术研究中心城市公共安全协同创新中心先进技术与产业协同创新中心先进核聚变能和等离子体科学协同创新中心安徽大数据应用协同创新中心微电子与光电子技术研究院安徽省医药生物研究院安徽省高校人文社科重点研究基地—科学传播研究与发展中心安徽省高校人文社科重点研究基地—工商管理创新研究中心安徽省高校人文社科重点研究基地—科技史与文化遗产研究中心安徽省语音及语言技术工程实验室安徽省发改委 安徽省技术标准创新基地（机器人）安徽省质量技术监督局、安徽省发改委等联合共建科研机构名称共建单位核探测技术与核电子学联合实验室中科院高能物理研究所化学物理联合实验室中科院大连化学物理研究所智能科学与技术联合实验室中科院沈阳自动化研究所蛋白质科学联合实验室中科院生物物理研究所网络与通信联合实验室中科院沈阳计算技术研究所星系和宇宙学联合实验室中科院上海天文台绿色合成化学联合实验室中科院上海有机化学研究所数学物理联合实验室中科院武汉物理与数学研究所网络传播系统与控制联合实验室中科院声学研究所科技传播研究所中科院科学时报社强子物理研究中心兰州重离子国家实验室新能源材料联合实验室中科院上海硅酸盐研究所无机固体联合实验室中科院福建物质结构研究所高分子薄膜与溶液联合实验室中科院长春应用化学研究所分析化学研究伙伴小组中科院长春应用化学研究所超精密控制与系统联合实验室中科院长春光机所微纳电子系统集成研究中心中科院微电子所环境污染控制联合实验室中科院城市环境研究所生物质催化转化联合实验室中科院广州能源研究所量子生物物理联合实验室中科院生物物理研究所天然活性多肽联合实验室中科院昆明动物研究所科大华为信息技术研究所深圳华为技术有限公司中国科学技术大学－SHINCRON先进薄膜工艺与材料联合实验室日本SHINCRON公司中国科大-黄山永佳膜技术与膜材料联合研发中心黄山永佳（集团）有限公司中国科大国购机器人研究中心合肥高新区、国购集团 森林火灾监测预警应急管理部重点实验室应急管理部四川消防研究所 重大科学装置据2016年8月学校官网信息显示，学校先后建设和参与建设了合肥同步辐射加速器、北京谱仪（BESIII）、稳态强磁场、大天区多目标光纤光谱天文望远镜（LAMOST）、子午工程等大科学装置
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