云南农业大学热带作物学院科研机构截至2022年9月，学院有农业农村部综合试验站1个、国家市场监督管理局技术创新中心1个、省部级科普工作站1个、省级工程研究中心3个（含分中心1个）、省级工程技术研发辐射中心1个、校级研究中心1个、院级专家工作站8个
农业农村部综合试验站：天然橡胶普洱综合试验站 国家市场监督管理局技术创新中心：国家市场监管技术创新中心（咖啡质量基础与产业服务） 省部级科普工作站：全国农产品质量安全与营养健康科普工作站 省级工程研究中心：云南省高校天然橡胶绿色生产工程研究中心、云南省高校咖啡资源开发与利用工程研究中心、云南省优势中药材规范化种植工程研究中心（普洱分中心） 省级工程技术研发辐射中心：面向南亚东南亚咖啡工程技术研发辐射中心 校级研究中心：云南农业大学热区健康饮料研究中心 院级专家工作站：黄华孙专家工作站（橡胶）、龙宇宙专家工作站（咖啡）、李积华专家工作站（食品）、张秀梅专家工作站（果树）、赵松林专家工作站（棕榈）、王祝年专家工作站（中草药）、李汉棠专家工作站（农业大数据）
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