西南医科大学学科建设截至2023年3月，学校拥有博士专业学位授权点1个，一级学科硕士学位授权点8个、硕士专业学位授权点10个；临床医学、药学是四川省一流建设学科

 国家级博士后科研工作站：心血管医学研究所博士专业学位授权点：临床医学 一级学科硕士学位授权点：基础医学、临床医学、中西医结合、药学、中医学、中药学、护理学、口腔医学硕士专业学位授权点：临床医学、口腔医学、公共卫生、中医学、护理、公共管理、法律、体育、药学、应用心理 校园环境重点学科、专科国家中医药管理局重点学科：中西医结合临床 国家临床（中医）重点专科：脑病科、肾病科、整形外科（批准部门：卫生部） 脑病科、肾病科、肝病科、耳鼻咽喉科、重症医学科（批准部门：国家中医药管理局） 四川省一流（建设）学科：临床医学、药学 四川省重点学科：内科学（心血管病学）、生理学、中西医结合临床、病理与病理生理学、影像医学与核医学、内科学（传染病学） 四川省医学重点学科：周围血管外科、心血管内科、呼吸内科、内分泌科、肝胆外科、儿科、核医学科、神经外科、神经内科、肾病内科、胸心外科、肿瘤科、医学检验科、耳鼻喉头颈外科、消化内科、临床护理学、麻醉学（附属中医医院）、康复医学、药剂学、病理科、围产医学、皮肤病学、麻醉学（附属医院）、口腔内科、口腔临床医学、口腔颌面外科、口腔正畸学、口腔修复学 四川省医学重点专科：心血管病科、脑病科、脾胃病科、肺病科、肾病科、肝病科、耳鼻咽喉科、骨伤科、皮肤科、肛肠科、肿瘤科、妇产科、儿科 西南医科大学学科评估截至2023年3月，学校临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学进入ESI全球排名前1%，其中临床医学在ESI全球排名前1%机构中位列33.83%

 全国第四轮学科评估结果序号学校代码学科名称一级学科代码一级学科名称评估结果位次百分比110632西南医科大学1002临床医学C-60%～70%参考资料： 2018年全国首次专业学位水平评估结果序号学校代码学校名称专业学位代码专业学位名称评估结果位次百分位110632西南医科大学1051临床医学C-65%～75%参考资料： 

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