昆明医科大学科研平台截至2022年12月，学校有教育部创新团队1个，省创新团队31个，教育部国际合作联合实验室1个，国家卫健委重点实验室1个，教育部省部共建协同创新中心1个，国家干细胞临床备案机构3个，国家干细胞临床研究备案项目1项，国家级资质认定和认可实验室（中心）2个，省级重点实验室、省级临床医学研究中心、技术研究中心、基地等104个

 教育部国际合作联合实验室：教育部高原区域性高发肿瘤国际合作联合实验室国家卫健委委省共建重点实验室：卫健委毒品依赖和戒治重点实验室教育部“创新团队发展计划”培育团队：高原光损伤性皮肤疾病机制及综合防治研究团队（2012年，何黎）国家级资质认定和认可实验室（中心）：昆明医科大学司法鉴定中心等云南省哲学社会科学研究基地：云南医疗改革与健康社会科学研究基地云南省级重点实验室：云南省天然药物药理重点实验室、云南省干细胞和再生医学重点实验室、云南省肺癌研究重点实验室、云南省细胞治疗技术转化医学重点实验室、云南省口腔医学重点实验室等云南高校重点实验室：云南省高校神经科学重点实验室、云南省高校肿瘤防治重点实验室，云南省高校口腔医学重点实验室、云南省高校药学重点实验室、云南省高校热带传染病重点实验室、云南省高校黑色素瘤综合治疗重点实验室、云南省高校营养与食品安全重点实验室等云南省高校工程研究中心：云南省高校生物医学工程研究中心、云南省高校外科重大疾病诊治工程研究中心、云南省高校康复医学工程研究中心、云南省高校人类重大疾病动物模型建立及应用工程研究中心等云南省国际联合研究中心：神经科学干细胞生物学分子免疫学结构生物学及基因IT国际联合研究中心等云南省国际科技合作基地：云南省滇美分子药物国际联合研究中心、云南省热带传染病示范型国际科技合作基地、肿瘤综合防治示范型国际科技合作基地等 

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