中国科学院新疆分院西部大开发近年来，以江泽民总书记为核心的党中央做出了加快我国西部地区开发的重大战略决策，为西部地区的发展创造了前所未有的机遇；中国科学院启动知识创新工程；2002年又提出新时期的办院方针

根据中科院的要求，新疆分院系统已经完成学科整合和专业凝练进入知识创新工程

结合新疆经济发展的需求，新疆分院系统将在以下几个方面重点开展工作：――利用现代化手段进行干旱区的资源、环境生态综合数据平台的建设，并把它作为西部开发的基础性工作

――西部干旱区生态环境演变趋势和预测，绿洲形成和绿洲生态结构及其稳定性，退化生态系统的重建和生态安全系统的设计

――干旱区水系统循环过程数据收集、动态监测和合理利用设计，并在此基础上建立以水资源合理利用和节水技术结合为技术主体的流域生态农业区、荒漠生态农业区示范基地

――以石油为主体的能源资源开发中的强化开采技术及相关的油田化学产品的研究和产业化

――石油天然气化工新技术和新产品，BTX凝析油中试和产业化

――干旱区生物资源的有效成分的研究，提取方法研究，深加工和产业化技术

――创新的生物化学制品，耐旱、耐盐碱的生物资源的功能基因的研究，及这些优势基因向农作物的转移和新品种选育

――以高分子化学方法，进行新疆优势农副产品的二次三次加工，例如糖酯系列化表面活性剂的开发和应用

――太阳能和太阳能次生能源的利用及储存，以及相应的新材料研究

――电子信息技术和新材料在传统产业和新产业中的应用计算机网络信息系统及INTERNET在国民经济中的应用

――建立高层次人才培养的基地，培养生态科学、环境科学信息科学和生物化学方面的人才

――组织科普宣传专家组，建设高水平的科普基地

――以多种形式加大院地合作的广度和力度

包括科技项目合作、科技成果产业化和科技副职的选派

通过以上工作的实施，新疆分院系统将为新疆的国民经济发展，特别是农业、能源、新兴产业的发展做出基础性、创新性、前瞻性的贡献

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