河南农业大学科研机构截止2022年6月，学校建有国家“2011计划”河南粮食作物协同创新中心、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、国家小麦工程技术研究中心、新农村发展研究院、国家农村信息化示范省综合信息服务平台、动物免疫学国家国际联合研究中心、CIMMYT-中国（河南）小麦玉米联合研究中心等7个国际和国家研究平台，国家玉米改良（郑州）分中心、教育部高校林木种质资源创新和生长发育调控重点实验室、农业部动物生化与营养重点实验室、农业部农村可再生能源新材料与装备重点实验室、国家烟草栽培生理生化研究基地等97个省部级研究平台

 国家“2011计划”协同创新中心：河南粮食作物协同创新中心国家工程技术研究中心：国家小麦工程技术研究中心国家重点实验室：省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室国家级研究院：国家级新农村发展研究院教育部重点实验室（培育基地）：教育部作物生长发育调控重点实验室、教育部高校林木种质资源创新和生长发育调控重点实验室培育基地国家林业局工程技术研究中心：国家林业局农田防护林工程技术研究中心农业部重点实验室：农业部农村可再生能源重点开放实验室、农业部黄淮海作物生理生态与耕作重点实验室、农业部动物生长发育调控重点开放实验室、农业部黄淮海南部玉米生物学与遗传育种重点实验室、农业部农业微生物酶工程重点实验室、农业部农村可再生能源新材料与装备重点实验室、农业部动物生化与营养重点实验室农业部观测实验站：农业部黄淮海农业信息技术科学观测实验站、农业部河南烟草生物学与加工科学观测实验站、农业部华北小麦玉米轮作营养与施肥科学观测实验站其他部委科研机构：国家玉米改良（郑州）分中心、国家烟草栽培生理生化研究基地、国家烟草（行业）栽培生理生化重点实验室河南省重点实验室：河南省作物生长发育调控重点实验室、河南省农村可再生能源重点实验室、河南省动物性食品安全重点实验室、河南省肉制品加工与质量安全控制重点实验室、河南省果树瓜类生物学重点实验室、河南省动物生长发育调控重点实验室、河南省新型农药创制与应用重点实验室河南省工程技术研究中心：河南省家禽种质资源创新工程研究中心、河南省农村沼气工程技术研究中心、河南省设施园艺工程技术研究中心河南省工程实验室：速冻米面及调制食品河南省工程实验室、水稻河南省工程实验室、饲料营养河南省工程实验室、农产品冷链物流信息与装备技术河南省工程实验室、河南省害虫生物防控工程实验室、动物生物制品河南省工程实验室其他省级科研机构：河南省牛业研究所、河南省人兽共患病国际联合实验室、河南省家禽育种国际联合实验室 

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