中国人民解放军空军工程大学科研机构据2017年12月学校官网信息显示，学校拥有1个国家重点实验室，5个军队重点实验室
国家级重点实验室：航空等离子体动力学国防科技重点实验室军队重点实验室：飞机推进系统实验室、某型先进飞机综合实验室、防空导弹微波应用实验室、地面防空作战指挥实验室、军用导航实验室
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