内蒙古医科大学学术资源图书馆截至2020年9月，内蒙古医科大学图书馆纸质文献总量163.23万册

校本部图书馆有纸质文献120.45万册，电子图书26.01万册，电子期刊50.09万册，学位论文57.82万册

医学类纸质图书37.21万册，中医学类图书7.56万册

年订购期刊1126种，其中中文刊1111种，外文刊15种

现有数据库76个，其中包含中国知网、维普期刊资源整合服务平台、万方数据知识服务平台、超星电子图书、Web of Science、SciFinder、Medline、Elsevier ClinicalKey全医学平台、Springer-Link、Dialog等中外文数据库及蒙医药图书全文数据库、蒙医药期刊全文数据库、蒙医药博硕论文数据库、民族医药期刊书目数据库、蒙古文工具书全文数据库等自建数据库

特色收藏有甘珠尔经（108卷）、丹珠尔经（124卷）、《乾隆大藏经》、《万有文库》及古籍文献等珍贵文献3万余册，其中中医古籍文献4945册

 学术期刊《内蒙古医科大学学报》是由内蒙古医科大学主管主办的医药卫生综合性学术期刊，于1959年创刊，系双月刊，中国国内外公开发行

 学报开辟有论著（基础医学、临床医学、预防医学）、蒙医药论坛、技术与方法、经验交流、短篇、综述等栏目

 《内蒙古医科大学学报》为中国科技论文统计源期刊（中国科技论文核心期刊）（2008、2010、2011版科技论文统计源期刊目录期刊），曾获Caj-cd规范获奖期刊奖，并被《中国科学引文数据库》、《中文生物医学期刊数据库》、《中国学术期刊（光盘版）数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》、 《中文科技期刊数据库》、《中文科技资料目录》、《全国报刊索引》、《中国药学文摘》和《中国医学文摘》（7个分册）等中国国内外大型数据库收录

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