中国热带农业科学院农产品加工研究所科研部门截至2017年12月，研究所承建国家、省、部级科技平台16个
国家级工程技术研究中心：国家重要热带作物工程技术研究中心国家农产品加工技术研发体系果品加工专业委员会技术创新平台：国家农产品加工技术研发热带水果加工专业分中心农业部重点实验室：农业部热带作物产品加工重点实验室广东省工程技术研究中心：广东省天然乳胶制品工程技术研究中心、广东省特色热带作物产品加工工程技术研究中心海南省重点实验室：海南省天然橡胶加工重点实验室、海南省果蔬贮藏与加工重点实验室 所级创新团队：天然橡胶加工团队、农业纳米科学团队、食品加工团队、农产品质量安全团队、橡塑复合材料团队
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