新疆医科大学附属医院截至2023年1月，学校有直属附属医院8所，均为三级甲等医院；第二附属医院是民政部“明天计划”脑瘫手术康复治疗定点医院；第五附属医院是自治区首批三级甲等综合性医院；第八附属医院是“自治区公共卫生救治中心”“自治区结核病研究所”，自治区新冠肺炎医疗救治定点医院
直属附属医院一览表名称等级新疆医科大学第一附属医院三甲新疆医科大学第二附属医院三甲新疆医科大学附属肿瘤医院三甲新疆医科大学附属中医医院三甲新疆医科大学第五附属医院三甲新疆医科大学第六附属医院三甲新疆医科大学第七附属医院三甲新疆医科大学第八附属医院三甲资料来源：
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