新疆农业大学教学建设截至2014年12月，该校建有7个本科专业成为国家特色专业建设点，11个本科专业成为自治区重点产业紧缺人才专业，建成教育部棉花工程中心1个、国家级实验教学示范中心1个、自治区级实验教学示范中心7个，建成国家精品视频公开课4门（截至2018年4月），建成自治区级精品课程19门

“十一五”以来共获国家级教学成果二等奖1项，自治区高等教育教学成果一等奖4项、二等奖4项、三等奖6项

截至2022年6月，学校有15个国家级一流本科专业建设点，12个自治区级一流本科专业建设点，3门国家级一流课程，28门自治区级一流课程

 国家特色专业：园艺、水利水电工程、农业资源与环境、种子科学与工程、动物科学、农学、草业科学国家专业综合改革试点项目：水利水电工程 教育部优势专业：草业科学、农业资源与环境国家卓越工程师教育培养计划：农业机械化及其自动化专业、计算机科学与技术专业（软件工程方向）国家卓越农林人才培养计划：草业科学、动物科学、农业水利工程 国家级实验教学示范中心：动物生产与疫病防制实验教学中心国家级精品视频公开课：外来生物的影响：以新疆为例、新疆多民族文化自治区级实验教学示范中心：草业科学实验教学中心、干旱区水利工程实验教学中心、农业资源与环境实验教学中心、作物生产类实验教学中心、农业与农村信息技术实验教学中心、林果实验教学中心、现代农业装备实验教学中心自治区高等学校教学创新团队：作物栽培学与耕作学教学团队、植物保护学教学团队、草地资源与生态教学团队、土壤学教学团队、动物科学专业教学团队自治区重点产业紧缺人才专业：水利水电工程、动物科学、动物医学、食品科学与工程、林学（林果病虫害防治）、种子科学与工程、农业水利工程、农业机械化及其自动化、农业资源与环境、设施农业科学与工程、机械设计制造及其自动化（风电工程方向）自治区精品课程：植物学、动物营养学、家畜病理学、土壤学、普通昆虫学、动物生理学、微生物学、家畜寄生虫学、工程水文学、农业经济学、水力学、草地资源调查规划学、作物栽培学、C语言程序设计、果蔬采后生理学、果树栽培学、种子生物学、牛生产学、遗传学            

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