南京航空航天大学自动化学院学科建设据2020年2月学院官网显示，学院有3个博士后流动站，3个一级学科博士点，12个二级学科博士点，15个二级学科硕士点，2个国家重点（培育）二级学科，3个江苏省一级重点学科，2个“十二五”江苏省优势学科一期、二期重点建设学科，2个南京航空航天大学“高峰学科”

 博士后流动站：仪器科学与技术、电气工程、控制科学与工程一级学科博士点：仪器科学与技术、电气工程、控制科学与工程二级学科博士点：精密仪器及机械，测试计量技术及仪器，电机与电器，电力系统及其自动化，电力电子与电力传动，电工理论与新技术，控制理论与控制工程，检测技术与自动化装置，系统工程，模式识别与智能控制，导航、制导与控制二级学科硕士点：精密仪器及机械，测试计量技术及仪器，电机与电器，电力系统及其自动化，电力电子与电力传动，电工理论与新技术，控制理论与控制工程，检测技术与自动化装置，系统工程，模式识别与智能控制，导航、制导与控制，武器系统与运用工程，兵器发射理论与技术，火炮、自动武器与弹药工程，生物医学工程

国家重点（培育）二级学科：电力电子与电力传动，导航、制导与控制国防重点二级学科：电力电子与电力传动，导航、制导与控制“十二五”江苏省重点一级学科：仪器科学与技术、电气工程、控制科学与工程 “十二五”江苏省优势学科一期、二期重点建设学科：电气工程、控制科学与工程南京航空航天大学“高峰学科”：电气工程、控制科学与工程 

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