曼哈顿学院专业设置曼哈顿学院下属的以下学院可提供本科生课程：商学院、艺术学院、教育学院、工程学院、科学学院
开设研究生课程的学院包括：提供辅导、特殊教育以及学校管理与监督学位的研究生教育学院;以及开设化学、土建、环保、电气、计算机与机械工程学位课程的研究生工程学院
专业按照学院细分如下：商业学院：会计、计算机信息系统、经济学、金融、国际商业研究、管理学、市场营销
工程学院：化学工程、土木工程、计算机工程、电子工程、环境工程、机械工程
理科学院：生物、生物化学、数学和计算机科学、物理、自然科学
研究生：文科：大学/社区咨询、学校咨询
教育科学：特殊教育、学校管理和监督
职业文凭：学校顾问、咨询教师、教育技术、学校管理和监督、高级领导学
工程：化学工程、土木工程、计算机工程、电子工程、环境工程、机械工程
理科：生物工艺学
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