广东省科学院生态环境与土壤研究所人才培养研究所先后与中国科学院广州地球化学研究所、中国科学院地球化学研究所、华南理工大学、广东工业大学、华南农业大学、广州大学、福建农林大学、山西农业大学、石河子大学等科研院所和高校联合招收研究生或设立研究生培养基地
截至2018年，研究所有硕士研究生导师14名，博士研究生导师4名；在读研究生52名，其中博士生14名
据2019年4月研究所官网资料显示，自2005年后累计培养了硕士研究生117名，博士研究生47名
2007年毕业的刘承帅博士获2016年度国家“万人计划”青年拔尖人才，2008年毕业的刘同旭博士获得2016年国家优秀青年基金，2009年度毕业的陶亮博士和李晓敏博士获得2016年度广东省自然科学杰出青年基金
2011年，广东省生态环境技术研究所开始通过广东省科学院博士后科研工作站直接独立招收博士后研究人员
研究所的博士后工作接受广东省科学院博士后科研工作站统一管理，下设广东省科学院博士后管理委员会、博士后学术委员会、博士后管理办公室及所级博士后管理办公室（设在研究所业务办）
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