京都大学数理解析研究所研究机构数理研由三个部门组成，分别为「基础数理研究部门」、「无限解析研究部门」、「应用数理研究部门」，以及四个附属设施，为「计算机研究中心」、「数学连携中心」、「次世代几何学研究中心」，「数理解析研究交流中心」
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