中国水产科学研究院黄海水产研究所学科建设据2017年1月研究所官网显示，研究所与上海海洋大学联合培养的2017年硕士研究生招生专业有：一级学科博士点2个、二级学科博士点2个、一级学科硕士点6个、二级学科硕士点5个、专业硕士学位点4个
与浙江海洋学院联合培养的硕士研究生招生专业有：一级学科硕士点2个、二级学科硕士点2个、专业硕士学位点1个
研究所设有博士后科研工作站
与上海海洋大学联合培养一级学科博士点：食品科学与工程、生物学 二级学科博士点：水产养殖、渔业资源 一级学科硕士点：海洋科学、生物学、生态学、环境科学与工程、食品科学与工程、机械工程 二级学科硕士点：应用化学、临床兽医学、水产养殖、捕捞学、渔业资源 专业硕士学位点：机械工程、食品工程、渔业 与浙江海洋学院联合培养一级学科硕士点：海洋科学、水产 二级学科硕士点：海洋生物学与生物海洋学、水产养殖 专业硕士学位点：农业推广
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