陕西省微生物研究所机构设置本所下设四个研究中心——微生物菌种资源研究中心、微生物技术研究中心、代谢产物研究中心、分子生物学实验室
一个省级工程技术研究中心——陕西省淀粉转化工程技术研究中心
一个中心实验室
两个产业部门——食用菌技术推广中心和陕西博奥制药有限公司
近五年来发表论文48篇,编、专著4部,申请发明专利9项授权4项,获陕西省科学院、西安市科技局科技奖励共7项
获中国科学院院地合作项目、陕西省科技计划项目、西安市科技计划项目、中科院西部之光项目、陕西省科学院科技计划项目共51项
同研究院所、企业及农业技术推广单位等签订联合开发、科技合作和技术服务协议书共31份
其中取得横向联合开发、委托开发及技术服务等项目共计25项
通过陕西省科技厅、西安市科技局、陕西省科学院成果鉴定或验收的项目共35项
在韩城、陕南建立了食用药用真菌试验示范基地
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