北京市疾病预防控制中心承担任务承担全市传染病、慢性非传染性疾病、地方病、学生常见病、公共卫生突发事件应急处理、消毒及病媒生物防制、食品、化妆品、涉水产品、一次性卫生用品等与健康密切相关的生活用品的卫生学检测评价及卫生毒理学测试、劳动卫生和职业病防治、射线防护、从业人员健康体检、建设项目预防性卫生学评价、健康教育等预防医学领域各项工作
承担预防医学各学科的科学研究；承担全市卫生防病信息的统计、分析
与首都医科大学共建公共卫生与家庭医学学院，承担预防医学各专业的本科教学工作
北京市预防医学会、首都预防医学杂志、北京市艾滋病检测中心、北京性病艾滋病防治协会等机构也设在中心
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