北京市疾病预防控制中心所获荣誉2020年9月8日，被评为全国抗击新冠肺炎疫情先进集体
2020年12月，被评为“全国科普工作先进集体”
2021年3月15日，被北京市委办公厅、北京市人民政府办公厅授予“北京市扶贫协作先进集体”称号
2021年4月1日，被首都绿化委员会办公室和北京市人力资源和社会保障局评为“2020年度首都全民义务植树先进单位”
2021年6月，北京市疾病预防控制中心党委被中共中央授予“全国先进基层党组织”称号
2021年10月，被表彰为“第六届全国专业技术人才先进集体”称号
2022年4月，入选北京冬奥会、冬残奥会突出贡献集体表彰名单
2022年4月，荣获2022年首都劳动奖状
2022年4月，拟表彰为“北京冬奥会、冬残奥会北京市先进集体”
2022年4月，入选北京2022年冬奥会、冬残奥会北京市先进集体名单
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