轨道交通控制与安全国家重点实验室成立过程轨道交通控制与安全国家重点实验室筹备于2005年，2006年5月获科技部批准建设，2008年2月通过科技部委托国家自然科学基金委组织的评估，2008年底，实验室开始以实体化方式运作
实验室主任为“百千万人才”国家级人选唐涛教授，学术委员会主任为中国工程院院士、轨道交通专家孙永福教授，常务副主任为国家杰出青年基金获得者、国家973计划项目首席科学家高自友教授
此实验室是在整合教育部重点实验室“交通运输智能技术与系统实验室”、铁道部重点实验室“运输自动化与通信实验室”、“交通运输系统模拟实验室”、北京市重点实验室“城市轨道交通自动化与控制”、国家认可实验室“电磁兼容实验室”以及铁道部“GSM-R研究与应用模拟系统实验室”的基础上，依托“交通运输规划与管理”、“交通信息工程及控制”、“通信与信息系统”三个国家级重点学科及全国评估排名第一的“系统科学”学科而成立
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