医药生物技术国家重点实验室（南京大学）项目成果多年来，实验室紧紧围绕以上三个研究方向，立足原始创新，2001年以来通过竞争共承担和完成各类研究项目350多项，年均研究经费约2000万元

实验室以承担国家级基础研究课题为主，约占项目总数的40%，研究经费约占总经费的80%，其中包括国家973项目（1项为首席主持）、国家863项目、国家十五重点攻关项目、国家科技基础性工作项目、国家杰出青年基金、国家自然科学基金重点项目等

100万以上的技术转让与合作开发项目20余项，合同金额达3440万元

建室以来，本室共获得各类奖项20多项，其中国家级奖4项，省部级奖9项，特别是“尿激酶原的蛋白质工程：结构和功能关系的研究” 在尿激酶原（pro-UK）/尿激酶（UK）内源性催化活性的结构基础和生理学意义、pro-UK/UK的高效表达和复性研究以及第二代pro-UK/UK的设计和研究方面取得重大突破，于2000年获国家自然科学二等奖；“若干重要药用植物的成份研究” 为植物内生真菌的认识与利用、相关新药的研发提供了新线索，建立的方法对相关研究具有广泛的参考价值，获2010年国家自然科学二等奖；获得国内发明专利61项，美国发明专利2项；实验室获新药临床批件12件；发表研究论文1200多篇，其中SCI论文800多篇，约占论文总数的70%，影响因子10.0以上的9篇；出版著作23部

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