山东大学文化遗产研究院主攻方向古史重建和中华文明起源一向是山东大学考古学科的主攻方向，未来文研院将仍然瞄准这一方向，从器物-技术、制度-社会、文化-认知和环境变迁等角度，揭示我国主要区域社会的复杂化进程，阐释中华文明起源的机制和早期形态，并通过与世界各主要文明区在国家形成和早期国家形态方面的比较研究，探索、总结中华文明的特质及动因，在文明起源理论建设上形成山大学派
文研院将进一步密切与高校、政府、企事业单位、国外大学和研究机构的合作关系，大力加强协同创新，求得学科和平台的可持续性发展
山东大学文化遗产研究院主体位于山东大学青岛校区博物馆内，专业和研究方向涵盖了实验室考古发掘、文化遗产保护、植物考古、动物考古、有机质文物保护、无机质文物保护、青铜器研究、文化遗产保护及规划、古代人骨研究、古DNA研究、古人类学研究、考古残留物分析、文物微生物病害防治和断代考古等各个领域，总面积达5000余平方米
此外，在济南中心校区所建设的科技考古和文保实验室总面积也有800余平方米，能够独立完成可移动文物的保护修复工作
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