厦门大学台湾研究院科研部门根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院设6个研究所，6个跨学科研究机构，有国家级“2011计划”1个，教育部人文社科重点研究基地1个，教育部区域与国别研究培育基地1个
国家级“2011计划”：两岸关系和平发展协同创新中心教育部人文社科重点研究基地：厦门大学台湾研究中心教育部区域与国别研究培育基地：厦门大学港澳台研究中心 研究所：政治研究所、经济研究所、历史研究所、文学研究所、法律研究所、两岸关系研究所跨学科研究机构：民进党研究中心、两岸青年研究中心、大数据与民调研究中心、涉台外交研究中心（筹）
以上内容由大学时代综合整理自互联网，实际情况请以官方资料为准。
