中国藏学研究中心藏医药研究所内设机构及其职能藏医药研究所内设藏医研究室、藏药研究室、文献研究室，其职责是：（一）藏医研究室职责负责藏医学基础理论的研究；负责藏医学医疗技术的研究；运用和借鉴现代医学技术，推动藏医诊断和治疗技术规范化和医疗体系的现代化；推动藏药治疗疑难病症独特的疗效
（二）藏药研究室职责负责藏药药理、药性的研究，改革藏药剂型，科学研发和配制藏药，使藏药逐步实现标准化，规范化；开展藏区藏药资源的调查，建立藏药材培植基地，为临床及患者提供经国家批准的新特藏药
（三）文献研究室职责负责收集整理古代、现代藏医药学文献资料，藏医器械、传统藏药炮制加工用具并进行研究与创新；负责编目藏医药大全，藏医药图谱；负责管理和利用传统藏医档案
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