上海中医药大学中西医结合研究院研究方向以国家科技、卫生发展规划、社会重大需求为导向，坚持 “国际化、现代化、继承，创新”的指导思想；立足于中医药发展和国家科创中心建设要求；坚持自主创新与国际合作相结合、基础研究与临床相结合、中医学与现代科学相融合的建设方针，以建设一流的医学中心为目标，创新中西医结合学科的运行体制，推进中西医结合的科学研究和学科人才培养；搭建基础医学与附属医院的临床学科的合作平台和运行机制
研究院将聚焦中医药防治疑难重大疾病、中医核心理论的科学内涵、中西医结合关键科学问题等方向，充分发挥学科、人才、平台的优势，联合攻关，形成标志性成果，打造一流的学科和人才队伍
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