南京博物院对外交流早在20世纪50年代，南京博物院就参与国家组织的文物展览前往苏联、德国等国家展出
改革开放以来，与国际上的学术交流日益增加，在美国、法国、德国、意大利、比利时、荷兰、芬兰、日本、韩国、港澳台等国家和地区举办院藏文物展，弘扬民族文化，增进国际交流
与日本国立九州博物馆、韩国古宫博物馆、美国宾夕法尼亚州费城自然科学院签订了“学术文化交流协议书”，并在此基础上开展了友好交流活动
与国外学术单位之间的科研合作也日益增多，佛教南传、早期水稻田遗址考古、江南人骨研究、泗阳汉墓出土木质文物保护研究等都取得了瞩目成绩
后又与美国大都会艺术博物馆、加拿大皇家安大略博物馆、台北故宫、日本国立九州博物馆、韩国古宫博物馆等海内外文博机构签订了合作协议书，并开展了大量学术和文化活动
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