中国近代史遗址博物馆建设意义总统府‘象征着中国两千多年封建统治的终结，而且曾经是清代两江总督署和太平天国天王府所在地，总统府在各个时期的建筑交错叠加但又不显凌乱，反映了这三个不同历史时期的风貌
南京总统府既有历史厚重感又有独特的建筑风格，百分之九十的建筑仍在；而与；总统府有关的文物则在多年的战火和社会变迁中流失，馆藏无几，因此博物馆最后被定位为遗址博物馆，主要展示两江总督署、太平天国天王府遗址和中华民国国民政府旧址
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