南昌大学学报（医学版）荣誉表彰1989年，该刊获全国高等学校自然科学学报优秀质量三等奖；获全国高等医药学院校优秀学报二等奖
1992年，该刊获全国优秀科技期刊评比三等奖（国家科委、中共中央宣传部、新闻出版署）；获全省首届优秀科技期刊二等奖
1993年，该刊获华东地区优秀期刊三等奖
1995年，该刊获全国高等学校自然科学学报系统优秀学报一等奖（国家教育委员会科学技术司）；获全省高等学校自然科学学报系统优秀学报二等奖（江西省教育委员会）
1997年，该刊获第二届华东地区优秀期刊奖
1999年，该刊获全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊评比三等奖（中华人民共和国教育部）；获江西省高校自然科学学报评比一等奖
2001年，该刊被评为中国期刊方阵双效期刊”（国家新闻出版署）；获“《CAJ-CD规范》执行优秀奖”
2008年，该刊获江西省优秀期刊三等奖
2009年，该刊获全国高校科技期刊优秀质量奖
2012年，该刊获江西省第四届优秀期刊二等奖；被评为华东地区优秀期刊
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