方精云人才培养讲授课程根据2021年2月北京大学官网显示，方精云独立讲授4门必修课：环境生物学（本科生）、群落生态学（本科生）、生态系统生态学（本科生）、植被生态学（研究生）；参与讲授3门课：生态学研究进展（研究生）、自然地理学研究进展（研究生）、生态学研究方法（研究生）
学生培养根据2021年2月北京大学官网显示，方精云共培养硕士生24名、博士生37名，指导28名本科生完成毕业论文（其中1名外国留学生），指导21名博士后出站
在指导的博士生中，2人获全国百篇优博，1人获全国优博论文提名奖；2人获基金委 “国家杰出青年基金”，5人获基金委“优青”；7人获中组部“青年千人”称号
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