万建民人才培养培养理念作为南京农业大学首位“长江学者奖励计划”特聘教授，万建民一直都有一个认识，那就是：一个人的力量，相对于整个国家的水稻分子遗传育种事业而言是十分微小的，而造就一批批、一代代的优秀人才，才是事业永续发展的根本

 万建民在科研中推崇操行、学问和素质，也以此要求学生

他说，操行就是要有献身和协作精神，在工作中一定要“全力以赴、实事求是”

他还非常注重培养学生的科研创新意识、勤于思考和单独开展科学研究的能力

他提出“说、写、组织能力、循序渐进”四要素，要求博士生参与课题申请书的撰写，从课题酝酿、撰写、打印和呈交，整个过程都要清楚熟悉；组织能力和循序渐进就是要求研究生参与导师的各项课题，从小事做起，增强自身的组织能力和交往能力，为独立开展科研工作打下基础

 培养成果1999年5月，回到南京农业大学的万建民，承担起作物育种学、高级遗传学、作物遗传改良原理与方法和作物学进展等本科生及硕士、博士生课程的教学工作

此后，万建民担任了中国农科院作科所所长，但仍然承担着作物遗传育种学的教学任务，经常在学术报告中，向学生讲授中国国内外作物遗传育种的基础知识和研究进展，讲解水稻重要性状形成的分子机制，水稻育种原理、方法以及实验室主要开展的研究工作

 截至2015年12月，万建民培养博士46名，3名获全国优秀博士学位论文提名奖；此外他指导研究生大规模地鉴定和筛选中国国内外种质资源以及自行创造的大量突变体材料，从60000多份材料中，筛选到淀粉突变体2000余份，各种类型的蛋白突变体60多份，开展水稻外观、食味、营养等品质优异基因挖掘和分子育种研究，分选17个品质相关基因，阐明了控制谷蛋白合成、分选、运输及积累的分子机理；构建了品质改良分子育种技术体系，培育优质粳稻新品种

 2018年，万建民所领衔的团队“水稻遗传育种创新团队”获评2018年江苏省首届十佳研究生导师团队

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