王耀南建国之后1951到1952年，任绥远军区参谋长的王耀南到朝鲜负责解决志愿军的防空和防重炮问题，提出坑道战的战术，解决了志愿军的防空和防重炮的问题
1955年9月后，因病休息五年
1960年，任解放军工程兵司令部副参谋长
1970年，担任工程兵副司令员
1984年11月3日6时25分，王耀南的心脏停止了跳动，离开了他钟爱的工兵部队和事业，享年73岁
王耀南生前主动提出把遗体献给医学研究事业，为四化建设做最后的贡献
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