陈吉宁研究方向长期致力于环境系统分析方面的研究工作，致力于将系统分析的方法和工具应用于环境工程、规划、管理和政策研究，特别是如何解决复杂环境问题的综合性评估及其中的不确定性问题
组织、承担和参与了多项国家攻关、重大专项、基础研究以及国际联合科研项目等
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