吴自良荣誉表彰1980年，当选为中国科学院技术科学部学部委员
1989年，获得中国科学院荣誉奖章；同年被国务院侨务办公室、中华全国归国华侨联合会授予“全国优秀归侨、侨眷知识分子”称号
1990年，被中国科学院评为“优秀研究生导师”
1997年，获得何梁何利基金科学与技术进步奖
1999年9月，被中共中央、国务院、中央军委授予“两弹一星”功勋奖章
2008年，被中科院研究生院授予“杰出贡献教师”荣誉称号
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