杜如晦秦府高参隋朝大业十三年（617年），太原留守李渊父子在太原起兵，挥军杀入长安

长安平定后，杜如晦被李世民召入秦王府任为法曹参军，而后被迁升为陕州总管府长史，视为亲信

而太子李建成见秦王府有非常多的人才，害怕威胁到自己的地位，于是向唐高祖李渊建议将秦王府的官员都调到外地任职

命令下达之后，被迁到外地的人非常多，李世民对此非常担忧

当时在秦王记室的房玄龄对李世民说：“府中幕僚虽然被迁往外地的人比较多，但是没有什么好可惜的，只有杜如晦聪慧，能洞察事理，这个人有王佐之才，大王如果为镇一方，那用不上他，但如果以后要经略天下，那就非杜如晦不可，只有此人才能帮你大忙

”李世民听到房玄龄的话后才醒悟过来，对房玄龄说道：“你要是不说，差点让这样的人才流失啊

”于是李世民向李渊上奏，请求将杜如晦继续留在秦王府为官

唐武德元年（618年），李渊建立唐朝，同年七月，陇西薛举进犯泾州，李世民率军前往讨伐，但被击败

而后薛举突然病死，李世民再次出兵讨伐其子薛仁杲，并让杜如晦等随军参赞军事

薛仁杲兵败投降，后被斩首

武德二年（619年），刘武周与宋金刚攻据太原，杜如晦随从李世民前往讨伐，将刘武周击退

武德三年（620年），李世民率军进攻洛阳王世充，而王世充又与窦建德联合，杜如晦随李世民先破窦建德，后破王世充

李世民在征讨薛仁杲、刘武周、王世充、窦建德等割据势力时，杜如晦随从李世民参赞军事，为李世民运筹帷幄，判断军势，李世民根据杜如晦的判断准确出击，将各地反王一一消灭

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