令狐楚身处乱局大和七年（833年）六月，令狐楚入朝任吏部尚书，仍为检校右仆射

按旧例，加“检校”衔于高一级官位的官员，即班列高位

令狐楚因自己的正官为三品，不应从就二品班列，奏请从就三品本官班列，文宗下诏嘉奖

 大和九年（835年）六月，转任太常卿

十月，代理尚书左仆射，进封彭阳郡开国公

十一月，“甘露之变”爆发，京师大乱

当夜，文宗召右仆射郑覃与令狐楚进宫，商量拟制敕令

文宗打算将二人都任用为宰相

令狐楚觉得宰相王涯、贾餗遭冤而死，在列叙他们的罪状时浮泛含糊

权宦仇士良等非常不高兴，因此将改授李石为相，令狐楚则以本职兼任盐铁转运使

 此前，宠臣郑注曾上密奏设置榷茶使，由盐铁使兼领

令狐楚就任后，奏请取消设置榷茶使；他又建议各镇节度使参谒谢恩时，只穿公服，不许备置仪仗及兵器；令狐楚还奏请取消用于修缮曲江亭的一万三千七百匹绢，改用为修缮尚书省

文宗对他的上述建议都予以采纳

 开成元年（836年）三月初三上巳节，文宗在曲江亭宴请百官

令狐楚因为刚刚诛杀宰相等人，不应赏赐欢宴，于是独自称病不前往，受到议论者的称美

令狐楚厌恶宦官擅权，多次上疏请求解职

四月，令狐楚出任检校左仆射、兴元（今陕西汉中）尹，充任山南西道节度使

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