丁健荣誉表彰时间荣誉表彰授予单位2006年吴阶平―保罗·杨森医学药学奖国家卫生健康委国际交流与合作中心2008年何梁何利基金科学与技术进步奖何梁何利基金委员会2009年中国工程院院士中国工程院2011年科技部“十一五”国家科技计划执行突出贡献奖科技部2012年全国优秀科技工作者中国科学技术协会2015年发展中国家科学院院士发展中国家科学院2016年谈家桢生命科学奖—成就奖谈家桢生命科学奖奖励委员会2017年中国科学院杰出科技成就奖中国科学院 2019年中国医学科学院学部委员中国医学科学院2020年中国科学院上海药物研究所终身成就奖中国科学院上海药物研究所2020年全国创新争先奖章人力资源社会保障部、中国科协、科技部、国务院国资委
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