吴付来主要论文1、《关于“思想道德修养” 课贯彻<公民道德建设实施纲要>精神的教学建议》（12000字，合撰，教育部社政司组织），《思想理论教育导刊》2002年第3期；2、《“立公废私”——先秦法家公私论的道德价值取向》（10000字），《伦理学》（人大报刊复印资料）1999年第7期；3、《儒墨经权论之比较》（11000字），《中国哲学》（人大报刊复印资料）1998年第1期；4、《试论儒学经权论的逻辑走向》（12000字），《安徽师范大学学报》1996年第1期；5、《新闻出版行业的道德建设》（15000字），载“21世纪伦理学术前沿论坛文集”《全球化进程中的伦理建设研究》，党建读物出版社2002年7月出版；6、《我是谁——关于克隆人的技术与伦理之争》（6500字）（访谈），《中国经营报》2002年1月28日；7、《生命不可承受之“轻”——生命价值的伦理思考》（5300字）（访谈），《中国经营报》2002年8月26日；
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