南京市金陵中学汇文书院时期1888年（清朝光绪十四年）10月2日，美国基督教美以美会在清朝江苏省江宁府干河沿创建汇文书院
书院内设博物院（文理科）、医学馆（医科）、圣道馆（神学），并设有附属中学、附属医院等
1890年，汇文书院创办成美馆，正式设立中学部
1892年，书院授课分为大学堂、高等学堂、中学堂、小学堂四级，每级学制均为四年
1888年-1898年间，汇文书院先后建造了钟楼、图书馆（青年会所在地，亦作琥珀厅）、口子楼（亦作考吟堂）、东课楼、西课楼等建筑
汇文书院设立之时，中国的科举制度尚未完结
书院的创办对中国近代高等教育的产生发展、培养新兴高级人才具有积极而深远的影响
20世纪初，由于中国社会风气的转变，教会学校逐渐引起人们的注意，汇文书院开始与地方官员有所接触
学校举行毕业典礼时，许多地方官员曾应邀出席，这而其中包括两江总督张之洞、端方、张人骏等
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