南京市金陵中学南京市金陵中学时期1988年5月，经南京市人民政府批准，学校由南京市第十中学更名为南京市金陵中学

杨祖恒校长邀请著名书法家、全国政协副主席赵朴初先生题写了校牌，同时聘请了陈裕光先生为名誉校长

20世纪80年代，金陵中学建立了包括必修课、选修课、劳动技术课、社会实践和课外活动在内的比较完整的教育体系的探索和实践

20世纪90年代，学校新建了曹隐云科学馆、行健楼、汇贤楼、汇智楼等建筑

1996年10月，金陵中学在初步建立起教学体系的基础上，制订了《以学分为制约和激励机制的高中全面素质教育改革方案》，努力探索一条高中素质教育全面探索的改革之路

1997年，金陵中学开始开设高中、初中实验班

2000年1月，金陵中学率先于全国在高一、高二年级开设研究性学习课程

2002年11月，金陵中学与南京河西新城国资集团在奥体中心旁征地230亩，共同建设了金陵中学河西分校（南京市建邺区梦都大街60号）；2003年9月正式开学

 2006年，学校取消初中部

2008年9月，金陵中学与鼓楼区教育局、拉萨路小学投资1亿，联合创办的金陵汇文学校（南京市鼓楼区清江路19号）正式开学

该校拥有优秀先进的设备，幽雅的环境，尽职尽责的老师，是鼓楼区最大的初级中学

金陵中学与南京市建邺区教育局创办了金陵中学实验小学（南京市建邺区松花江西街6号）

2008年，金陵中学与南京实验国际学校（南京市高新区高新路10号）联合创办了“金陵中学课程改革实验基地学校”

2008年9月30日，金陵中学举行了南京市金陵中学建校120周年庆典活动

国家教育部、中国教育学会、江苏省教育厅、江苏省委书记、北京大学、清华大学、同根同源的南京大学、复旦大学、美国亚利桑那大学校长等发来了贺信，江苏省副省长何权出席并代表省政府向金陵中学表示热烈祝贺

2012年3月，金陵中学与南京市栖霞区人民政府、南京市仙林大学城管委会、南京市教育局、南京大学联合创办的金陵中学仙林分校（小学部）（南京市栖霞区仙林大道188号）正式招生开学

2014年9月，金陵中学仙林分校（初中部）、金陵中学岱山分校、金陵中学龙湖分校正式招生开学

 2020年8月17日，南京市与南京大学联合召开共建“南京教育高质量发展创新示范区”会议，双方共同成立南京大学金陵教育集团，共建南京大学金陵中学

 9月28日，"南京大学金陵中学"举行授牌仪式

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