南京市第九中学硬件设施碑亭巷校区根据2018年11月学校官网显示，碑亭巷校区建有两幢教学楼，另有实验楼、篮球馆、文艺楼各一幢，有建筑面积达8000多平米的食堂及学生宿舍综合楼，宿舍每间住四人，有卫生间、太阳能热水器、空调、写字台，有数字化物理实验室和数字化化学生物实验室
震旦校区根据2018年11月学校官网显示，震旦校区拥有近10000㎡的教学大楼和300米环形塑胶跑道的全天候运动场，学校图书馆是省一级图书馆
学校设有信息中心，负责全校的信息化建设工作，有计算机教室3个，通用技术室2个，班班都是多功能教室，演播厅1个，监控室2个，能容纳二百余人的报告厅2个
学校于2000年建成有线网络，覆盖学校所有教室和办公室，2012年，获得首批青奥学校建设项目，建成智能无线校园网络，形成有线无线双覆盖，同年，全市数字化校园建设与评估首批合格学校
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