南京市秦淮中学学校荣誉办学三十年来，学校先后被评为江苏省文明单位、省德育先进学校、省绿色学校、省园林式单位、省模范职工之家、省平安学校、省体育人才后备学；南京市文明单位、南京市十大景观学校、南京市首批园林式校园、南京市体育传统项目学校、校党总支部被评为南京市先进基层党组织，校团委被评为省红旗团委，多次获得南京市普通高中发展性评估综合奖和高考质量优秀奖，多年连续获得江宁区先进学校、江宁区办学效能评估一等奖、办学效益千分考核一等奖、区校务公开先进学校等一系列荣誉称号
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